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发布时间 2026-09-23 8 天前
来源 GitHub TypeScript
字数 2,517 字
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AI智能总结

AIPOCH 推出面向可复现科学研究的 AI 研究工作台 AIPOCH Open-Science,采用开源、本地优先、与模型无关的设计,覆盖 macOS、Windows 和 Linux。

面向可复现科学研究的 AI 研究工作台 —— 开源、本地优先、与模型无关。

AIPOCH Open-Science 是面向科学家与研究者的 AI 研究工作台,由 AIPOCH 开发,采用开源、本地优先、与模型无关的设计理念。它通过科研智能体(scientific AI agents)、Python 与 R 执行环境、科学数据连接器,以及对 macOS、Windows 和 Linux 的跨平台支持,使可复现、可审查的研究成为可能。创建一个项目,用自然语言描述你的研究目标,让智能体读取文件、检索网页、运行代码、查询科研数据源,并产出带有可追溯来源的报告、表格与图表 —— 所有工作都在同一个工作空间中完成。

AIPOCH Open-Science 支持跨学科的计算密集型与数据密集型研究,涵盖机器学习、统计学、生命科学、化学、材料科学、物理以及环境科学等领域。它为科研全流程提供支持:从文献综述与假设构建,到代码执行、数据分析、模拟、可视化,再到产出可追溯的研究成果。

💡 AIPOCH Open-Science v0.32.0 已发布 (最后更新于 2026 年 9 月)。AIPOCH Open-Science v0.32.0 让 PDF 证据具备持久性,并使成果物导出具备互操作性:持久化批注与按文件管理的文档笔记(document notebook),可将文字样式、区域标记、注释、评论、颜色与标签与其所属的文件版本一同保留,在不改动源文件字节的前提下导出为带批注 PDF 或 Markdown/CSV;经验证的成果物版本现已打包为完整的 RO-Crate 归档,并附带其精确输入。序列与组学工作流新增异步 NCBI BLAST 检索、可获取 ENA 测序原始提交文件的运行发现、PRIDE 项目文件清单,以及按基因或物种检索 UniProt 蛋白数据的能力。安装本地 PDF 解析模型不再依赖单一下载源,这归功于经验证的镜像源;能力选择(capability selection)可指向自托管的自定义分类服务;无人值守的 CLI 运行可被禁止等待人工介入。借助批处理恢复、延迟执行的 Markdown 任务以及更轻量的观察者开销,启动速度与长时间对话的运行速度均得到提升。完整细节请参阅最新发布说明。

AIPOCH Open-Science 横幅:Science, Open to All —— 一个开源、与模型无关、可自托管的科研 AI 研究工作台

目录

🚀 快速开始

1. 下载应用

打开最新发布页,展开 Assets,选择适合你电脑的安装包:

你的电脑 选择
macOS 12+ —— Apple Silicon(M1 或更新) 适用于 Apple Silicon / ARM64 的 macOS DMG
macOS 12+ —— Intel 适用于 Intel / x64 的 macOS DMG
Windows x64 适用于 Windows x64 的安装包
Linux x64 适用于 Linux x64 的 AppImage 或 Debian 包

请从官方发布页下载;如有必要,可参阅下载校验说明。

在 macOS 上,你也可以使用 Homebrew 安装:

brew install --cask open-science

Windows 端的重装会保留研究数据。如需完全清理,请参阅数据重置工具,该工具会在确认后永久删除本地数据。

2. 完成首次设置

按设置向导依次进行:环境 → 数据位置 → 智能体运行时 → 模型提供方 → Notebook 运行时。

完成必要的环境与智能体运行时检查,并测试你的模型连接。Python/R Notebook 设置为可选项;Notebook 与数据位置设置可在之后更改。

![AIPOCH Open-Science 自动进行的首次运行环境检查](docs/images/readme/onboarding-environment.jpg)
![AIPOCH Open-Science 首次运行的模型提供方配置](docs/images/readme/onboarding-model-provider.jpg)

主机兼容性、存储与网络检查
提供方、API Key、端点与模型验证

3. 启动研究项目

  1. 点击 New project(新建项目),打开一个会话,描述你的研究目标、输入与预期输出。
  2. 附加文件,选择模型与审批模式,然后发送任务。使用 @ 引用项目中的文件,或使用 / 选择一项技能(skill)。
  3. 审阅工具活动与任何审批请求,预览结果,并在 Provenance(来源) 中查看可用证据。

本 README 中的截图用于说明工作流。标签、目录以及其他界面细节可能与你安装的版本略有不同。

产品演示

从研究请求到可追溯的结果

以一项具有代表性的生物信息学任务为例:复现一篇已发表的差异表达分析,将重新生成的结果与论文进行比对,并交付审阅所需的报告、表格与图表。下面的截图来自 AIPOCH Open-Science 已记录的工作流中的典型视图,用于说明各个阶段,而非一次完整连续的会话。

1. 定义研究任务与证据

描述研究问题、源论文与数据集、所需方法或阈值、预期输出以及验收标准。上传支撑文件,或使用 @ 引用已有的项目成果物,使智能体从明确的输入出发,而非依赖隐式上下文。

AIPOCH Open-Science 论文复现任务,研究结论、生成的成果物与源对比在同一个工作空间中可见

2. 使用可审查的科研工具执行

智能体可在共享的 Notebook 中组合使用科研技能、受权限管控的研究连接器、检索、文件操作以及 Python 或 R 代码。生成的图表可与研究摘要并列查看,而成果物记录(artifact record)会展示所捕获的生成代码与执行证据,便于审查。

AIPOCH Open-Science 生物信息学分析,研究摘要、生成的图表与捕获的生成代码并列显示

3. 就地审阅报告、表格与图表

最终回复会总结哪些结果得到复现、哪些出现差异,以及哪些限制值得关注。生成的 Markdown 报告、CSV 表格、图片以及其他研究成果物会保留在会话中,并汇集到项目文件库,可在会话旁预览,并复用于后续工作。

AIPOCH Open-Science 复现结果,差异表达图表与生成的文件在智能体旁预览

4. 将每个成果物追溯到其证据

每个生成的成果物都会以不可变、带校验和(checksum)的版本进行存储。其 Provenance(来源) 视图可展示生成代码与执行历史、所引用的输入、观测到的环境清单、生成该结果的会话分支,以及与版本绑定的审阅者(Reviewer)发现。无法验证的证据会被标记为不可用,而非凭空推断。

AIPOCH Open-Science 研究成果物预览,展示用于追溯生成结果的 Provenance 条目

基准性能

🏆 在 BiomniBench-DA Public 50 上排名第一

AIPOCH Open-Science 在整理后的 BiomniBench-DA Public 50 对比中取得了最高排名分数,使用 gpt-5.6-sol (xhigh) 获得 79.05 分。该结果由 Gemini 3.1 Pro 评审给出的 81.04 分与 DeepSeek v4-pro 评审给出的 77.06 分按等权平均合并而成,使 AIPOCH Open-Science 在所收集的 Public 50 结果中位列 #1。请查阅 BiomniBench-DA 数据集。

BiomniBench-DA Public 50 对比,AIPOCH Open-Science 以 79.05 分排名第一